2013年9月19日木曜日

文献管理ソフト

windows8 64bit, intel corei5-3317U@1.7GHz, 4..0GB memory

imageのみの古いpdf論文もあり、それらも検索するために手でabstract、検索keywordを書くという使い方を私はします。

pdf内検索ができるのは当然で、その他の点を上げると

Mendeley (Desktop)

長所:
  • 古い論文でもpdf informationからyear/title/author程度は自動で入れてくれる。
  • 動作が軽い。
短所:
  • Mendeley server上にpdfを置かない設定にしているが、毎回なにやらserverと通信をしておりそれに結構時間がかっている。どこまで情報がuploadされているのか不安。
  • pdf informationがない場合に結構いい加減な情報を入れている。確認が必要。
  • Nature,Scienceなどpage途中で始まる論文の場合に違う論文の情報になっていることがある。
  • Mendeley serverが止まっていたり、障害があり通信できないと論文情報を自動で全く取れない。(と書いている現在も障害がおきて論文情報を補完できない。)なお、serverが止まっていても自動補完機能以外は問題なく使える。
  • 新しくファイルを登録した時しか文献のlookupができない。その時にinternet connectionができないと、もしくはMendeley serverがdownしていると論文の詳細を自動的に探せない。一度delete document,remove from collectionしても内部に情報が残っているらしく、Mendeley上で削除しても二度目はlookupできない。最初の登録時にinternet connectionができないと、もしくはMendeley serverがdownしていると論文の詳細を自動的に探さない。
以下FAQより、関連事項
----------------------------------------------------

Update References (automated DOI lookup)

...
I can update a reference via manual "doi lookup". Bit this is annoying when I will lookup thousands of references. I have to click for each single entry the "doi lookup" button.

Is there a way to automate this process?

Thanks
Christof


Best Answer 
Robert Knight Feb 27, 2012 03:14PM GMT
> Is there a way to automate this process?

There isn't currently a way to do a batch DOI lookup for multiple documents at once.

If you imported the documents from PDF files, Mendeley will try to do a lookup automatically if it finds a DOI, but this only works if you have an internet connection when the import happens.

-----------------------------------------------------------
papers2のように確信がなければ情報を何も入れないなどとできる補完レベルを指定できるとbetter。今のところこれが最も私の使い方に合う。

papers2

長所:
  • 完全にstandaloneで動く。
  • そのわりに結構論文情報を取ってくれる。
短所:
  • userがfree wordの検索文字を書き込めない。
  • abstractは改行を取って一行にしないとabstract欄に全て入らない。普通にコピペすると一行目のみ挿入される。
  • windows版は動作が重い。多分interpreterのソフト。
古い論文も検索に入れたい場合にabstractを簡単にコピペできず、また検索タグにfree wordを書けないので私の場合は致命的にNG。

readcube

natureと提携しているというので期待しましたが、

短所:
  • Adobe AIRが同時にinstallされるinterpreterのソフト。windows版は動作がかなり重い。
  • pdf informationから情報を全然取らない。なかなか情報取りのgive upをしない。情報を取れない場合の表示が意味不明。
という理由ですぐuninstall。